Recentemente tive a necessidade de juntar alguns arquivos de áudio no Linux, eu não quis usar um editar de áudio fiz o seguinte.
cat arquivo1.mp3 arquivo2.mp3 arquivo3.mp3 arquivo4.mp3 arquivo5.mp3 > ArquivoFinal.mp3
Pronto...
ou poderia ser feito assim
cat arquivo* > ArquivoFinal.mp3
Com o cat substitui o HJSplit. :)